Relación estructura-actividad de la inhibición de aminopeptidasas M1 de Escherichia coli (ePepN) y Plasmodium falciparum ( PfA-M1) por peptidomiméticos derivados de la bestatina
Palabras clave:
caracterización cinética, KBE009, modo de inhibición, relación estructura-actividadResumen
Las enzimas ePepN y PfA-M1 son dos alanil-aminopeptidasas M1 que son blancos en el tratamiento potencial de
infecciones microbianas y la malaria, respectivamente. El inhibidor clásico de las aminopeptidasas M1 es la besta-
tina. El peptidomimético sintético derivado de la bestatina KBE009 fue identificado previamente como un inhibi-
dor de PfA-M1 con actividad antimalárica in vitro. El objetivo de este trabajo fue evaluar una biblioteca sintética
de 10 peptidomiméticos derivados de la bestatina (KBE009) en la inhibición de ePepN y PfA-M1 recombinantes
(ePepNr y PfA-M1r), y estudiar la relación estructura-actividad resultante. En primer lugar, se determinaron las
principales características cinéticas de ePepNr y de la inhibición de ambas enzimas por la bestatina. Se determinó
la misma actividad de ePepNr a pH 7,0 y 8,0, así como una KM = 72 μM frente al sustrato Leu-p-nitroanilida. Una
preincubación de 5 min entre la bestatina y ePepNr es suficiente para establecer el equilibrio de inhibición, y la
bestatina es un inhibidor no competitivo de la enzima con una Ki = 2,31 μM . Por otra parte, para PfA-M1r es sufi-
ciente un tiempo de preincubación de 15 min, la Ki de la bestatina es 1,29 μM y este inhibidor es competitivo.
Aunque ningún compuesto es un inhibidor potente, las características estructurales de los peptidomiméticos deri-
vados de la bestatina (KBE009) que son favorables para la inhibición son: los grupos central isopropilo y terminal 3
-fenilpropilo en la ramificación (para ambas aminopeptidasas), los grupos central isopropilo y terminal ciclohexil
(para ePepNr), y los grupos central 2-furilo y terminal bencilo (para PfA-M1r). El compuesto KBE053, como repre-
sentante de esta serie, es un inhibidor incompetitivo de ePepNr con una Ki = 10,13 μM . Este conocimiento pudiera
contribuir al diseño de nuevos inhibidores de ePepN y PfA-M1
